Ein Team mit Beteiligung des SCC legt im Paper An ontology-based description of nano computed tomography measurements in electronic laboratory notebooks dar, wie am Beispiel synchrotronbasierter Nano‑CT Messungen experimentelle Metadaten von Beginn an FAIR-konform erfasst und semantisch annotiert werden können. Dies unterstützt alle nachgelagerten wissenschaftlichen Prozesse im Umgang mit den Forschungsdaten elementar. Das Paper ist im renommierten Fachjournal „Nature Scientific Data“ erschienen.
Im Forschungsdatenmanagement besteht das Problem, dass hochwertige, vollständig FAIR-konforme Forschungsmetadaten schwer zu erzeugen sind, insbesondere bei komplexen wissenschaftlichen Messungen. Hierzu bräuchte es Workflows, die eine frühzeitige, standardisierte, semantische und benutzerfreundliche Erfassung der Forschungsdaten definieren und Tools, die diese Prozesse unterstützen. Genau hier setzt das Paper der Arbeitsgruppe ab: Es beschreibt einen Ansatz, Forschungsdaten von Anfang mit Metadaten FAIR‑konform zu erfassen, indem der wissenschaftliche Workflow direkt in semantisch annotierte Knowledge Graphs eingebettet wird. Die Autoren initiieren die Erstellung eines Schemas (s. Bild) bereits zu Beginn des wissenschaftlichen Prozesses und implementieren dieses Schema anschließend in die elektronische Laborbuch-Plattform Herbie.
Diese Herangehensweise unterstützt, dass Metadaten automatisch validiert, Eingaben semantisch annotiert und Daten benutzerfreundlich erfasst werden. So können alle FAIR‑Prinzipien automatisch erfüllt werden.
Im Paper wird am Beispiel synchrotronbasierter Nano‑CT Messungen an einer Beamline gezeigt, wie komplexe Geräte‑ und Konfigurations-Metadaten vollständig und konsistent erfasst werden können. Das System generiert eine nutzerfreundliche Oberfläche aus den semantischen Beschreibungen und erlaubt eine strukturierte Nutzung der Daten über SPARQL‑Abfragen.
Zur Publikation: An ontology-based description of nano computed tomography measurements in electronic laboratory notebooks
Kontakt am SCC: Dr. Rossella Aversa